遠(yuǎn)古之神"大蛇"企圖滅世，因而產(chǎn)生了兩位救世巫女。兩位巫女經(jīng)歷不停地輪回轉(zhuǎn)世，相遇后以兩人之力封印住大蛇。而原本只是普通高中生、卻為"日之巫女“轉(zhuǎn)世的來?xiàng)ё右约?quot;月之巫女"的轉(zhuǎn)世姬宮千歌音，為了再次封印大蛇，不得不想辦法召喚傳說中的劍神"天之叢云"。大蛇的八個(gè)仆人們(人性的八個(gè)黑暗面)為阻止兩人召喚天之叢云，而屢次對(duì)她們發(fā)動(dòng)襲擊；這時(shí)，原本應(yīng)該是"大蛇"之一、排名順序七的大神相馬因?yàn)榘祽偌ё右丫?，而背叛了大蛇的意志，屢次地拯救她們，但卻又引發(fā)了另一場(chǎng)風(fēng)波。不停輪回的兩人，無法分離的命運(yùn)，這是身為“神無月之巫女”的命運(yùn)。